Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants / Paul Savary

Public ISBD Aucun avis sur cette notice. Titre : Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants Type de document : texte imprimé Auteurs : Paul Savary, Auteur ; Jean-Christophe Foltête, Directeur de thèse ; Stéphane Garnier, Directeur de thèse Année de publication : 2021 Importance : 1 vol.(296 p.) Note générale : Thèse soutenue le 07-12-2021. Langues : Français (fre) Tags : écologie du paysage  génétique des populations  théorie des graphes  réseaux  connectivité des habitats Résumé : La connectivité écologique des habitats est nécessaire aux processus écologiques assurant le maintien de la biodiversité. Des méthodes ont donc été développées pour la modéliser afin de comprendre précisément son influence et d’orienter les mesures de conservation de la biodiversité. Parmi ces méthodes, les graphes paysagers modélisent un réseau d’habitat sous la forme d’un ensemble de taches d’habitat (nÅ“uds) reliées par des chemins de dispersion potentiels (liens). La validité écologique de ces outils nécessitait néanmoins d’être évaluée à l’aide de données reflétant les réponses biologiques des populations à la connectivité de leurs habitats. Les données génétiques permettent cette validation car la structure génétique des populations dépend notamment des flux génétiques entre leurs taches d’habitat. La structure génétique peut également être modélisée par un graphe génétique dont les nÅ“uds correspondent à des populations et dont les liens sont pondérés par le degré de différenciation génétique entre populations. L’objectif de cette thèse était d’utiliser conjointement des graphes génétiques et paysagers pour (i) évaluer la validité écologique des graphes paysagers et (ii) améliorer notre compréhension de la relation entre connectivité et structure génétique. Après avoir identifié les méthodes de construction et d’analyse des graphes génétiques les plus adaptées à chaque contexte et développé un outil informatique permettant l’utilisation conjointe des graphes génétiques et paysagers, nous les avons comparés dans le cadre de deux études empiriques. Elles ont permis (i) d’évaluer l’influence respective des différentes composantes de la connectivité des habitats sur la diversité et la différenciation génétiques et (ii) de confirmer la validité écologique des graphes paysagers. Nous avons ensuite montré que l’intégration de variables associées à la fois aux nÅ“uds et aux liens de ces deux types de graphes améliorait l’estimation de l’influence des éléments du paysage sur la connectivité. Les méthodes développées dans cette thèse pourraient trouver d’autres applications dans ce champ d’étude comme dans d’autres. Nous espérons que les résultats de cette thèse et l’outil informatique développé y contribueront. Note de contenu : Préparée à l'UMR ThéMA et à l'UMR 6282 Biogéosciences (UBFC) - Financée par l'entreprise ARP-Astrance. Niveau : Recherche Publication de Théma : Oui Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants [texte imprimé] / Paul Savary, Auteur ; Jean-Christophe Foltête, Directeur de thèse ; Stéphane Garnier, Directeur de thèse . - 2021 . - 1 vol.(296 p.). Thèse soutenue le 07-12-2021. Langues : Français (fre) Tags : écologie du paysage  génétique des populations  théorie des graphes  réseaux  connectivité des habitats Résumé : La connectivité écologique des habitats est nécessaire aux processus écologiques assurant le maintien de la biodiversité. Des méthodes ont donc été développées pour la modéliser afin de comprendre précisément son influence et d’orienter les mesures de conservation de la biodiversité. Parmi ces méthodes, les graphes paysagers modélisent un réseau d’habitat sous la forme d’un ensemble de taches d’habitat (nÅ“uds) reliées par des chemins de dispersion potentiels (liens). La validité écologique de ces outils nécessitait néanmoins d’être évaluée à l’aide de données reflétant les réponses biologiques des populations à la connectivité de leurs habitats. Les données génétiques permettent cette validation car la structure génétique des populations dépend notamment des flux génétiques entre leurs taches d’habitat. La structure génétique peut également être modélisée par un graphe génétique dont les nÅ“uds correspondent à des populations et dont les liens sont pondérés par le degré de différenciation génétique entre populations. L’objectif de cette thèse était d’utiliser conjointement des graphes génétiques et paysagers pour (i) évaluer la validité écologique des graphes paysagers et (ii) améliorer notre compréhension de la relation entre connectivité et structure génétique. Après avoir identifié les méthodes de construction et d’analyse des graphes génétiques les plus adaptées à chaque contexte et développé un outil informatique permettant l’utilisation conjointe des graphes génétiques et paysagers, nous les avons comparés dans le cadre de deux études empiriques. Elles ont permis (i) d’évaluer l’influence respective des différentes composantes de la connectivité des habitats sur la diversité et la différenciation génétiques et (ii) de confirmer la validité écologique des graphes paysagers. Nous avons ensuite montré que l’intégration de variables associées à la fois aux nÅ“uds et aux liens de ces deux types de graphes améliorait l’estimation de l’influence des éléments du paysage sur la connectivité. Les méthodes développées dans cette thèse pourraient trouver d’autres applications dans ce champ d’étude comme dans d’autres. Nous espérons que les résultats de cette thèse et l’outil informatique développé y contribueront. Note de contenu : Préparée à l'UMR ThéMA et à l'UMR 6282 Biogéosciences (UBFC) - Financée par l'entreprise ARP-Astrance. Niveau : Recherche Publication de Théma : Oui

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Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants / Paul Savary

Public ISBD Aucun avis sur cette notice. Titre : Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants : Annexes A - articles scientifiques Type de document : texte imprimé Auteurs : Paul Savary, Auteur ; Jean-Christophe Foltête, Directeur de thèse ; Stéphane Garnier, Directeur de thèse Année de publication : 2021 Importance : 1 vol.(205 p.) Note générale : Thèse soutenue le 07-12-2021. Langues : Français (fre) Tags : écologie du paysage  génétique des populations  théorie des graphes  réseaux  connectivité des habitats Résumé : La connectivité écologique des habitats est nécessaire aux processus écologiques assurant le maintien de la biodiversité. Des méthodes ont donc été développées pour la modéliser afin de comprendre précisément son influence et d’orienter les mesures de conservation de la biodiversité. Parmi ces méthodes, les graphes paysagers modélisent un réseau d’habitat sous la forme d’un ensemble de taches d’habitat (nÅ“uds) reliées par des chemins de dispersion potentiels (liens). La validité écologique de ces outils nécessitait néanmoins d’être évaluée à l’aide de données reflétant les réponses biologiques des populations à la connectivité de leurs habitats. Les données génétiques permettent cette validation car la structure génétique des populations dépend notamment des flux génétiques entre leurs taches d’habitat. La structure génétique peut également être modélisée par un graphe génétique dont les nÅ“uds correspondent à des populations et dont les liens sont pondérés par le degré de différenciation génétique entre populations. L’objectif de cette thèse était d’utiliser conjointement des graphes génétiques et paysagers pour (i) évaluer la validité écologique des graphes paysagers et (ii) améliorer notre compréhension de la relation entre connectivité et structure génétique. Après avoir identifié les méthodes de construction et d’analyse des graphes génétiques les plus adaptées à chaque contexte et développé un outil informatique permettant l’utilisation conjointe des graphes génétiques et paysagers, nous les avons comparés dans le cadre de deux études empiriques. Elles ont permis (i) d’évaluer l’influence respective des différentes composantes de la connectivité des habitats sur la diversité et la différenciation génétiques et (ii) de confirmer la validité écologique des graphes paysagers. Nous avons ensuite montré que l’intégration de variables associées à la fois aux nÅ“uds et aux liens de ces deux types de graphes améliorait l’estimation de l’influence des éléments du paysage sur la connectivité. Les méthodes développées dans cette thèse pourraient trouver d’autres applications dans ce champ d’étude comme dans d’autres. Nous espérons que les résultats de cette thèse et l’outil informatique développé y contribueront. Note de contenu : Préparée à l'UMR ThéMA et à l'UMR 6282 Biogéosciences (UBFC) - Financée par l'entreprise ARP-Astrance. Niveau : Recherche Publication de Théma : Oui Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants : Annexes A - articles scientifiques [texte imprimé] / Paul Savary, Auteur ; Jean-Christophe Foltête, Directeur de thèse ; Stéphane Garnier, Directeur de thèse . - 2021 . - 1 vol.(205 p.). Thèse soutenue le 07-12-2021. Langues : Français (fre) Tags : écologie du paysage  génétique des populations  théorie des graphes  réseaux  connectivité des habitats Résumé : La connectivité écologique des habitats est nécessaire aux processus écologiques assurant le maintien de la biodiversité. Des méthodes ont donc été développées pour la modéliser afin de comprendre précisément son influence et d’orienter les mesures de conservation de la biodiversité. Parmi ces méthodes, les graphes paysagers modélisent un réseau d’habitat sous la forme d’un ensemble de taches d’habitat (nÅ“uds) reliées par des chemins de dispersion potentiels (liens). La validité écologique de ces outils nécessitait néanmoins d’être évaluée à l’aide de données reflétant les réponses biologiques des populations à la connectivité de leurs habitats. Les données génétiques permettent cette validation car la structure génétique des populations dépend notamment des flux génétiques entre leurs taches d’habitat. La structure génétique peut également être modélisée par un graphe génétique dont les nÅ“uds correspondent à des populations et dont les liens sont pondérés par le degré de différenciation génétique entre populations. L’objectif de cette thèse était d’utiliser conjointement des graphes génétiques et paysagers pour (i) évaluer la validité écologique des graphes paysagers et (ii) améliorer notre compréhension de la relation entre connectivité et structure génétique. Après avoir identifié les méthodes de construction et d’analyse des graphes génétiques les plus adaptées à chaque contexte et développé un outil informatique permettant l’utilisation conjointe des graphes génétiques et paysagers, nous les avons comparés dans le cadre de deux études empiriques. Elles ont permis (i) d’évaluer l’influence respective des différentes composantes de la connectivité des habitats sur la diversité et la différenciation génétiques et (ii) de confirmer la validité écologique des graphes paysagers. Nous avons ensuite montré que l’intégration de variables associées à la fois aux nÅ“uds et aux liens de ces deux types de graphes améliorait l’estimation de l’influence des éléments du paysage sur la connectivité. Les méthodes développées dans cette thèse pourraient trouver d’autres applications dans ce champ d’étude comme dans d’autres. Nous espérons que les résultats de cette thèse et l’outil informatique développé y contribueront. Note de contenu : Préparée à l'UMR ThéMA et à l'UMR 6282 Biogéosciences (UBFC) - Financée par l'entreprise ARP-Astrance. Niveau : Recherche Publication de Théma : Oui

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01151003090159	THE.2021.SAV.2	Livre	Centre de Documentation	Disponible

Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants / Paul Savary

Public ISBD Aucun avis sur cette notice. Titre : Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants : Annexes B - Méthodes d'analyse statistique Type de document : texte imprimé Auteurs : Paul Savary, Auteur ; Jean-Christophe Foltête, Directeur de thèse ; Stéphane Garnier, Directeur de thèse Année de publication : 2021 Importance : 1 vol.(205 p.) Note générale : Thèse soutenue le 07-12-2021. Langues : Français (fre) Tags : écologie du paysage  génétique des populations  théorie des graphes  réseaux  connectivité des habitats Résumé : La connectivité écologique des habitats est nécessaire aux processus écologiques assurant le maintien de la biodiversité. Des méthodes ont donc été développées pour la modéliser afin de comprendre précisément son influence et d’orienter les mesures de conservation de la biodiversité. Parmi ces méthodes, les graphes paysagers modélisent un réseau d’habitat sous la forme d’un ensemble de taches d’habitat (nÅ“uds) reliées par des chemins de dispersion potentiels (liens). La validité écologique de ces outils nécessitait néanmoins d’être évaluée à l’aide de données reflétant les réponses biologiques des populations à la connectivité de leurs habitats. Les données génétiques permettent cette validation car la structure génétique des populations dépend notamment des flux génétiques entre leurs taches d’habitat. La structure génétique peut également être modélisée par un graphe génétique dont les nÅ“uds correspondent à des populations et dont les liens sont pondérés par le degré de différenciation génétique entre populations. L’objectif de cette thèse était d’utiliser conjointement des graphes génétiques et paysagers pour (i) évaluer la validité écologique des graphes paysagers et (ii) améliorer notre compréhension de la relation entre connectivité et structure génétique. Après avoir identifié les méthodes de construction et d’analyse des graphes génétiques les plus adaptées à chaque contexte et développé un outil informatique permettant l’utilisation conjointe des graphes génétiques et paysagers, nous les avons comparés dans le cadre de deux études empiriques. Elles ont permis (i) d’évaluer l’influence respective des différentes composantes de la connectivité des habitats sur la diversité et la différenciation génétiques et (ii) de confirmer la validité écologique des graphes paysagers. Nous avons ensuite montré que l’intégration de variables associées à la fois aux nÅ“uds et aux liens de ces deux types de graphes améliorait l’estimation de l’influence des éléments du paysage sur la connectivité. Les méthodes développées dans cette thèse pourraient trouver d’autres applications dans ce champ d’étude comme dans d’autres. Nous espérons que les résultats de cette thèse et l’outil informatique développé y contribueront. Note de contenu : Préparée à l'UMR ThéMA et à l'UMR 6282 Biogéosciences (UBFC) - Financée par l'entreprise ARP-Astrance. Niveau : Recherche Publication de Théma : Oui Utilisation conjointe de graphes génétiques et paysagers pour l'analyse de la connectivité écologique des habitants : Annexes B - Méthodes d'analyse statistique [texte imprimé] / Paul Savary, Auteur ; Jean-Christophe Foltête, Directeur de thèse ; Stéphane Garnier, Directeur de thèse . - 2021 . - 1 vol.(205 p.). Thèse soutenue le 07-12-2021. Langues : Français (fre) Tags : écologie du paysage  génétique des populations  théorie des graphes  réseaux  connectivité des habitats Résumé : La connectivité écologique des habitats est nécessaire aux processus écologiques assurant le maintien de la biodiversité. Des méthodes ont donc été développées pour la modéliser afin de comprendre précisément son influence et d’orienter les mesures de conservation de la biodiversité. Parmi ces méthodes, les graphes paysagers modélisent un réseau d’habitat sous la forme d’un ensemble de taches d’habitat (nÅ“uds) reliées par des chemins de dispersion potentiels (liens). La validité écologique de ces outils nécessitait néanmoins d’être évaluée à l’aide de données reflétant les réponses biologiques des populations à la connectivité de leurs habitats. Les données génétiques permettent cette validation car la structure génétique des populations dépend notamment des flux génétiques entre leurs taches d’habitat. La structure génétique peut également être modélisée par un graphe génétique dont les nÅ“uds correspondent à des populations et dont les liens sont pondérés par le degré de différenciation génétique entre populations. L’objectif de cette thèse était d’utiliser conjointement des graphes génétiques et paysagers pour (i) évaluer la validité écologique des graphes paysagers et (ii) améliorer notre compréhension de la relation entre connectivité et structure génétique. Après avoir identifié les méthodes de construction et d’analyse des graphes génétiques les plus adaptées à chaque contexte et développé un outil informatique permettant l’utilisation conjointe des graphes génétiques et paysagers, nous les avons comparés dans le cadre de deux études empiriques. Elles ont permis (i) d’évaluer l’influence respective des différentes composantes de la connectivité des habitats sur la diversité et la différenciation génétiques et (ii) de confirmer la validité écologique des graphes paysagers. Nous avons ensuite montré que l’intégration de variables associées à la fois aux nÅ“uds et aux liens de ces deux types de graphes améliorait l’estimation de l’influence des éléments du paysage sur la connectivité. Les méthodes développées dans cette thèse pourraient trouver d’autres applications dans ce champ d’étude comme dans d’autres. Nous espérons que les résultats de cette thèse et l’outil informatique développé y contribueront. Note de contenu : Préparée à l'UMR ThéMA et à l'UMR 6282 Biogéosciences (UBFC) - Financée par l'entreprise ARP-Astrance. Niveau : Recherche Publication de Théma : Oui

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